Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms