Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn5P68500 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn5P68500 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms