Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnab1P63143 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnab1P63143 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnab1P63143 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Kcnab1P63143 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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