Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snrpd3P62320 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms