Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rps29P62274 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms