Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms