Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms