Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CgnP59242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CgnP59242 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CgnP59242 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CgnP59242 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CgnP59242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CgnP59242 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CgnP59242 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CgnP59242 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CgnP59242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CgnP59242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CgnP59242 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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