Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl3P58873 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl3P58873 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms