Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms