Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf2P58021 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf2P58021 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms