Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms