Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bace1P56818 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms