Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irf5P56477 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irf5P56477 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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