Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GemP55041 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GemP55041 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GemP55041 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GemP55041 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms