Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms