Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP53609 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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