Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Map3k1P53349 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Map3k1P53349 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms