Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms