Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn1swP51491 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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