Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl9P51410 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl9P51410 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms