Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MipP51180 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MipP51180 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MipP51180 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MipP51180 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms