Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnt2P50752 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms