Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms