Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx3P50481 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms