Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LtbrP50284 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LtbrP50284 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LtbrP50284 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms