Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms