Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms