Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp3P49194 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms