Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CitP49025 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CitP49025 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CitP49025 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CitP49025 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms