Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms