Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rplp1P47955 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rplp1P47955 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms