Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms