Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms