Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms