Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd1P40201 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms