Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms