Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc5P35689 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms