Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpardP35396 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpardP35396 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpardP35396 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpardP35396 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpardP35396 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpardP35396 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpardP35396 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PpardP35396 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpardP35396 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms