Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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