Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sftpa1P35242 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sftpa1P35242 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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