Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp12P34960 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp12P34960 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp12P34960 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms