Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SsbP32067 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SsbP32067 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SsbP32067 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SsbP32067 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SsbP32067 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SsbP32067 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SsbP32067 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SsbP32067 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SsbP32067 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SsbP32067 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SsbP32067 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SsbP32067 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SsbP32067 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms