Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sstr1P30873 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms