Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msr1P30204 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms