Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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