Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxraP28700 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxraP28700 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxraP28700 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxraP28700 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxraP28700 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxraP28700 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxraP28700 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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