Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NapbP28663 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NapbP28663 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NapbP28663 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NapbP28663 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NapbP28663 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms