Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BgnP28653 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BgnP28653 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BgnP28653 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BgnP28653 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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