Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apex1P28352 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms